RANKING of ligands in PDB fitting to SARS proteinase model
PDB(Protein Data Bank)に登録されているタンパク質構造データに含まれるリガンド情報のうち、SARSプロテアーゼのリガンドとして適すると推定されるものを調査し、ランキング付けいたしました。
下記のPDB IDをクリックすると画像が表示されます。

補足
リガンド情報を取得した基となる各構造データはProtein Data Bankのキーワードサーチ欄にPDB IDを入力し、検索を行うことにより取得可能です。
PDBデータを閲覧する為のRasmolのダウンロード方法はこちらをご覧ください。

      RANK	PDB ID containing ligands
         1	1p9u_1
         2	1b9j
         3	1bfz
         4	1o9s
         5	1epp
         6	1mcc
         7	1gbm
         8	2lpr
         9	1jev
        10	1m21
        11	1b3f
        12	1obh
        13	1cqq
        14	334d
        15	1mcs
        16	2srt
        17	1b58
        18	1esz
        19	1qin
        20	1kuk
        21	1b7h
        22	1i5g
        23	1a85
        24	1njn
        25	1olc
        26	1mcj
        27	1b48
        28	1umt
        29	4apr
        30	1h23
        31	1kne
        32	1o0r
        33	1ad8
        34	1cnw
        35	1jx2
        36	1fvv
        37	1vwa
        38	1p9u_2
        39	1eat
        40	1bc5
        41	1a7c
        42	1kyd
        43	1hte
        44	1b32
        45	1b3g
        46	1b05
        47	1h0g
        48	1p04
        49	1b4z
        50	11ba

The 1p9u_1 ligand structure of rank 1 complexed with SARS proteinase was shown in the figure of P-conformation 1.

The 1p9u_2 ligand structure of rank 38 complexed with SARS proteinase was shown in the figure of P-conformation 2.