HUMAN TRANSCRIPTION FACTOR COMPLEXED WITH DNA (HETERO DIMER OF JunB AND FosB) Based on the paper ("Comprehensive Identification of Human bZIP Interactions with Coiled-Coil Arrays" Science, 300, 2097-2101, 2003), we constructed this model using FAMS Ligand&Complex. HEADER TRANSCRIPTION/DNA SOURCE HOMO SAPIENS REMARK HETERO DIMER OF JunB AND FosB REMARK CHAIN_A JunB AAA74915 (272-329) REMARK CHAIN_B FosB AAB53946 (158-215) REMARK CHAIN_C DNA REMARK CHAIN_D DNA (cJUN,FosB)=(28,31) is the binding score of 7,the meaning of which is written in the above Science journal. The following matrix shows the binding score, and the 7 and 1 are the strongest binding and the weakest binding, respectively. 1 2 3 4 5 6 12345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012 -------------------------------------------------------------- 1 | 65545161222222222222222211212222216341111222222222222222222222 2 | 65555464222222222222112143112222215245433122222222222222221222 3 | 75551475212222221222122343112122116155443122122222222211221222 4 | 66636566111112006022200766111030057477560015121111113212221211 5 | 65544554222222221222222222222222216344111222222222222222222222 6 | 53346671222122222222222213222222214111112122221222222221222222 7 | 77765747222122130123200454113500065227677445211212110022122122 8 | 11311251222222222222222222222222224222222222222122222222222222 9 | 11111122767576121222144212222221221222222221222222322212222364 10 | 22222222766566122212244122222222222221221222222212122212221154 11 | 21222122777566501322144222222121222212222222221221111112221174 12 | 22222222666576501122144112222221222212222222221222112211221575 13 | 22222222767566112122233222222222222222222122222222222112122141 14 | 12222212666577132122144222222222222221222222222222221212221154 15 | 22221222211311666722244222222222222222222221220122221122111211 16 | 22222222222222173512144221222222222222222222222222222122222212 17 | 22211222212112665722155222222222212222112224222222222122222243 18 | 22222222222222775722233222222222222222222222222222222222222211 19 | 12222122222222222271622222113122122122222222222222222212222122 20 | 22222222222222222257722211222211125122122222225111112212222222 21 | 22222222222222212277722222222222222222222222112222122122122222 22 | 22222121434134443112277222212221222221211213221121221512121212 23 | 22222121414133443122266222222222222221221121211122221432111222 24 | 11142112222222222222222343554443541221322211222222112222222212 25 | 44451331222222221222222555766555644223412156221122342212121222 26 | 65561530122112210114222455767666756214431146110022452212111112 27 | 11121011311101121210122667534777762127605115113152302112111300 28 | 12121122222132222222122577322777762227713235222222212222222211 29 | 11111121222212222222122677122777752227620235222122222222222201 30 | 32122112121221222122222655777131114112222222142112212112112112 31 | 12212122221222212122222545677331114111212222142122212211111112 32 | 22222222122222222222222444777141321112222222142111111212112112 33 | 22122222222211221122222555767433133212212212142122211112112122 34 | 13341112222222221222222134445111124222122222112222222222222222 35 | 75675567222222212226222345222653342226425222611531122222222222 36 | 12212122222222222221222122222122222221221222222212222221222222 37 | 51171121222222222222222222222222222224222222221212222222222222 38 | 45554461222222223112243433777222235151346522112121131112221212 39 | 55645470212222005023200554667121255204460056212122113111221122 40 | 11142262121122222222222222222222222221156722222222222222222212 41 | 22121232222222222222211222112222221223256712222222221222222222 42 | 21222211122212111212111121111111012111265611111222222212111211 43 | 22212212222222222221222241443222222222322254117777772122222122 44 | 22212242122222221222211241554222222222422213227777772222222222 45 | 22212222222222222212111222222221223122222222772311412212111623 46 | 22222222222222111112122222222314122212222222652122542212121121 47 | 22222222222222222221222222222222222222222215216244222222222421 48 | 22222222311111222124222222222211123222222277341122222222212222 49 | 22222222222222222222222222122222221212222277225221222222222222 50 | 22222222222222222222222222222222222222222277227222222222222222 51 | 22222222544303221211212443122111121221222277572222221212312616 52 | 22222222222222222211222111222222222212222255232222222222212121 53 | 22222222122211222212111222222222222122222222222222226422212211 54 | 22222221111231112212255222222121222222221212212222225412112212 55 | 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222221222 56 | 22222222222222222222222222222222222222222222222222222224222222 57 | 22222222222222222222222222222222222222222222222222122222322222 58 | 22222221222222222211122222222221222222222222311111221111171121 59 | 22222222212222222211222222222222222222222222222221221221217122 60 | 22222222434134222222122222222334322222222211447132551221241227 61 | 22222222311131465422212222222222222222222222221222212112221262 62 | 22222221654115313321222222222222222212222222433111431111141716